Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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PtprbB2RU80 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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