Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rrn3B2RS91 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rrn3B2RS91 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms