Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H60cB1B213 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H60cB1B213 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms