Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms