Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms