Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm17190V9GX38 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms