Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms