Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thsd1Q9JM61 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thsd1Q9JM61 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thsd1Q9JM61 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thsd1Q9JM61 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thsd1Q9JM61 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thsd1Q9JM61 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thsd1Q9JM61 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thsd1Q9JM61 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thsd1Q9JM61 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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