Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rabgef1Q9JM13 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rabgef1Q9JM13 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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