Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms