Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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