Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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