Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms