Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ush1cQ9ES64 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms