Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms