Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms