Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nop56Q9D6Z1 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms