Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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