Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms