Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Wdr55Q9CX97 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Wdr55Q9CX97 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Wdr55Q9CX97 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Wdr55Q9CX97 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Wdr55Q9CX97 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Wdr55Q9CX97 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Wdr55Q9CX97 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Wdr55Q9CX97 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Wdr55Q9CX97 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Wdr55Q9CX97 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms