Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms