Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atxn3Q9CVD2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atxn3Q9CVD2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atxn3Q9CVD2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atxn3Q9CVD2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atxn3Q9CVD2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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