Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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