Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otud1Q9CUB6 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otud1Q9CUB6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otud1Q9CUB6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Otud1Q9CUB6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Otud1Q9CUB6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms