Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Smim8Q9CQQ0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms