Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Atp6v0e1Q9CQD8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
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