Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Rpl39lQ9CQD0 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Rpl39lQ9CQD0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Rpl39lQ9CQD0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Rpl39lQ9CQD0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl39lQ9CQD0 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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