Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4rQ99PI8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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