Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms