Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rcbtb2Q99LJ7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms