Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prpf19Q99KP6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms