Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms