Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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