Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Med28Q920D3 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms