Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nek8Q91ZR4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nek8Q91ZR4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nek8Q91ZR4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nek8Q91ZR4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nek8Q91ZR4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nek8Q91ZR4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nek8Q91ZR4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nek8Q91ZR4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nek8Q91ZR4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Nek8Q91ZR4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nek8Q91ZR4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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