Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Stx18Q8VDS8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Stx18Q8VDS8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Stx18Q8VDS8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Stx18Q8VDS8 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx18Q8VDS8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms