Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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