Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q7

Cerk, Ceramide kinase, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerkQ8K4Q7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CerkQ8K4Q7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CerkQ8K4Q7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CerkQ8K4Q7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CerkQ8K4Q7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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CerkQ8K4Q7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CerkQ8K4Q7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CerkQ8K4Q7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CerkQ8K4Q7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CerkQ8K4Q7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CerkQ8K4Q7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CerkQ8K4Q7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CerkQ8K4Q7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CerkQ8K4Q7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CerkQ8K4Q7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms