Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms