Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh13Q8CEE7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms