Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms