Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo3Q8C2S7 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Amigo3Q8C2S7 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo3Q8C2S7 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Amigo3Q8C2S7 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo3Q8C2S7 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms