Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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FarsaQ8C0C7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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FarsaQ8C0C7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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