Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx17Q8BVL3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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