Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms