Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubash3bQ8BGG7 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms