Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q8BGC1 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q8BGC1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q8BGC1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms