Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms