Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ckap2lQ7TS74 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ckap2lQ7TS74 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ckap2lQ7TS74 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ckap2lQ7TS74 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms