Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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